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Introduction

Les oomycètes sont des microorganismes eucaryotes filamenteux, occasionnant d’importants dégâts sur les plantes de grande culture comme le soja ou la pomme de terre. Les analyses de phylogénie moléculaire ont permis de positionner les oomycètes dans l’ordre des Heterokonts avec pour plus proches voisins

• les diatomées (Thalassossira pseudonana)
• les algues brunes (Ectocarpus siliculosus).

Ainsi malgré leur ressemblance morphologique, les oomycètes sont phylogénétiquement distincts des Fungi (Champignons) qui appartiennent à l’ordre des Opisthokonts. De par leur position distincte par rapport aux champignons, les moyens de lutte phytosanitaire développés contre les champignons, restent peu efficaces envers les oomycètes. Ainsi nombreuses sont les recherches qui visent à mieux caractériser les acteurs moléculaires impliqués dans la virulence de ces microorganismes afin de développer des moyens de lutte plus efficace.

Objectifs et Contexte Scientifique du TP

L’équipe du Dr Jones à partir d’un milieu de culture de l’oomycète Phytophthora sojae (parasite du soja) a purifié la protéine Physo_12. L’équipe souhaite maintenant définir la fonction de cette protéine et son histoire évolutive, afin d’établir si Physo_12 pourrait être un facteur de virulence du microorganisme, c'est-à-dire une protéine qui faciliterait l’infection/colonisation de l’hôte végétal.

L’ensemble des exercices du TP a pour but de répondre à ces deux objectifs. Il est basé sur des travaux publiés par Richards et al., 2011, PNAS