L2-L3 Bioinfo - TP Banques de données et analyse de séquences
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Revision as of 08:55, 17 February 2017
Introduction
Les TPs précédents ont permis de mettre en évidence l'implication de la séquence ATG5G46330 dArabidopsis thaliana dans les phénomènes analysés. L'idée est maintenant d'obtenir le maximum d'informations sur cette séquence (fonction, localisation, existence d'homologue..) afin d'établir une hypothèse quant au rôle ATG5G46330 dArabidopsis thaliana.
Recherche dans les bases de données
Les séquences biologiques (ADN, ARN, Protéines..) sont déposées et stockées dans différentes bases de données qu'il est possible d'interroger soit en utilisant des mots clés, soit des numeros d'acession ou encore en utilsant la séquence. Il existe
- des banques généralistes regroupant différents types d'informations
- des banques dédiées par exemple à un type de séqunces (ARN ou protéines) ou un type d'organismes (Arabidopsis, Drosophile..)
